Kulakovskiy I.V., Favorov A.F., Makeev V.J. (2009) Motif discovery and motif finding from genome-mapped DNase footprint data. Bioinformatics 25(18): 2318-2325.

<up> DMMPMM motif ZEN comparison [dmmpmm_compare_html]

motif alignment Bigfoot Bergman Down Noyes_hd Papatsenko Pollard SeSiMCMC motif similarity Bigfoot Pollard Down Bergman SeSiMCMC Papatsenko Noyes_hd Bigfoot 1.0 0.3052 0.3272 0.2801 0.3848 0.2755 0.2377 Pollard 0.3052 1.0 0.2965 0.319 0.3195 0.308 0.1431 Down 0.3272 0.2965 1.0 0.2664 0.4161 0.2226 0.1926 Bergman 0.2801 0.319 0.2664 1.0 0.2339 0.2869 0.1429 SeSiMCMC 0.3848 0.3195 0.4161 0.2339 1.0 0.2168 0.183 Papatsenko 0.2755 0.308 0.2226 0.2869 0.2168 1.0 0.1865 Noyes_hd 0.2377 0.1431 0.1926 0.1429 0.183 0.1865 1.0