Kulakovskiy I.V., Favorov A.F., Makeev V.J. (2009) Motif discovery and motif finding from genome-mapped DNase footprint data. Bioinformatics 25(18): 2318-2325.

<up> DMMPMM motif TLL comparison [dmmpmm_compare_html]

motif alignment Bigfoot Bergman Down Noyes Papatsenko Pollard SeSiMCMC motif similarity Bigfoot Pollard Down Bergman SeSiMCMC Papatsenko Noyes Bigfoot 1.0 0.526 0.2872 0.121 0.4555 0.2409 0.2772 Pollard 0.526 1.0 0.2333 0.0607 0.343 0.2503 0.2031 Down 0.2872 0.2333 1.0 0.1094 0.3486 0.2249 0.2041 Bergman 0.121 0.0607 0.1094 1.0 0.1186 0.2555 0.1148 SeSiMCMC 0.4555 0.343 0.3486 0.1186 1.0 0.2564 0.304 Papatsenko 0.2409 0.2503 0.2249 0.2555 0.2564 1.0 0.2385 Noyes 0.2772 0.2031 0.2041 0.1148 0.304 0.2385 1.0