Kulakovskiy I.V., Favorov A.F., Makeev V.J. (2009) Motif discovery and motif finding from genome-mapped DNase footprint data. Bioinformatics 25(18): 2318-2325.

<up> DMMPMM motif EVE comparison [dmmpmm_compare_html]

motif alignment Bigfoot Bergman Down Noyes Noyes_hd Pollard SeSiMCMC motif similarity Bigfoot Pollard Down Bergman SeSiMCMC Noyes Noyes_hd Bigfoot 1.0 0.1342 0.1903 0.0755 0.5538 0.1885 0.1503 Pollard 0.1342 1.0 0.1535 0.1144 0.1667 0.1806 0.1687 Down 0.1903 0.1535 1.0 0.2052 0.1648 0.3471 0.2231 Bergman 0.0755 0.1144 0.2052 1.0 0.0781 0.1751 0.2038 SeSiMCMC 0.5538 0.1667 0.1648 0.0781 1.0 0.1781 0.139 Noyes 0.1885 0.1806 0.3471 0.1751 0.1781 1.0 0.5477 Noyes_hd 0.1503 0.1687 0.2231 0.2038 0.139 0.5477 1.0